Maria João Novais é Mestre em Bioquímica aplicada à Biomedicina pela Universidade do Minho. Iniciou o seu percurso no Institut de Biochimie et de Génétique Cellulaires (IBGC), CNRS na Université Bordeaux Segalen, com o projeto de investigação mecanismos moleculares para ativação da proteína Bax durante a apoptose, cuja principal função consistiu na delineação e organização de experiencias laboratoriais, tratamento de dados e redação de conteúdos científicos. Em 2017, como bolseira de investigação do ISPUP, desempenhou funções como investigadora no projeto Geração 21, recolhendo informação sobre o crescimento e hábitos dos participantes do projeto.
Em 2020, integrou a equipa de trabalho de campo do programa de “Testes Serológicos para pesquisa dos anticorpos específicos para o vírus SARS-CoV-2 dirigido aos trabalhadores e alunos da Universidade do Porto”, desempenhou funções como coordenadora da equipa de campo, e gestão e correção de base de dados. Desde junho de 2021 que desempenha funções como Técnica superior para apoio ao projeto “Porto, Cidade sem Sida”, contribuindo para a gestão e analise de dados e produção de relatórios da Lisbon Cohort of Men who have Sex with men, e na Rede de Rastreio Comunitário.