Filipa Fontes nasceu em 1985, em Santa Maria da Feira, Aveiro, Portugal.
Licenciou-se em Enfermagem em 2007, obteve o mestrado em Epidemiologia em 2013 e concluiu o doutoramento em Saúde Pública em 2017, com a tese “O impacto da dor neuropática na qualidade do sono de doentes com cancro da mama”.
Atualmente, é Professora Convidada de Epidemiologia na Faculdade de Medicina do Porto e Investigadora Auxiliar no Grupo de Lesões Pré-cancerosas e Gestão Precoce do Câncer (PreCAM) do Centro de Investigação do IPO Porto (CI-IPOP).
É (co-)autora de mais de 40 publicações em revistas internacionais e de um capítulo de livro sobre epidemiologia do cancro.
Os seus interesses de investigação incluem o estudo da carga global do cancro e o seu impacto em resultados reportados pelos doentes.